由 Autoconf 生成的配置脚本通常被称为 configure 。在运行的时候，configure 创建了一些文件，在这些文件中以适当的值替换配置参数。

由 configure 创建的文件有：

• 一个或者多个 Makefile文件，在包的每个子目录中都有一个（参见 Makefile中的替换）；
• 有时创建一个C头文件，它的名字可以被配置，该头文件包含一些#define命令 （参见配置头文件）；
• 一个名为 config.status 的shell脚本，在运行时，它将重新创建上述文件。（参见重新创建一个配置）；
• 一个名为 config.cache 的shell脚本，它储存了许多测试的运行结果 （参见缓存文件）；
• 一个名为 config.log 的文件，它包含了由编译器生成的许多消息，以便于在configure出现错误时进行调试；

为了使用 Autoconf 创建一个 configure 脚本，你需要编写一个 Autoconf 的输入文件 configure.in 并且对它运行 autoconf 。如果你自行编写了特征测试以补充 Autoconf 所提供的测试，你可能还要编写一个名为 aclocal.m4 的文件和一个名为 acsite.m4 的文件。如果你使用了包含 #define 指令的 C 头文件，你可能还要编写 acconfig.h ，并且你需要与软件包一同发布由 Autoconf 生成的文件 config.h.in 。

下面是一个说明了在配置中使用的文件是如何生成的图。运行的程序都标以后缀 * 。 可能出现的文件被方括号( [] )括起来。 autoconf 和 autoheader 还读取安装了的 Autoconf 宏文件（通过读取 autoconf.m4 ）。

在准备发布软件包的过程中使用的文件：

你的源文件 --> [autoscan*] --> [configure.scan] --> configure.in

configure.in --.   .------> autoconf* -----> configure
               +---+
[aclocal.m4] --+   `---.
[acsite.m4] ---'       |
                       +--> [autoheader*] -> [config.h.in]
[acconfig.h] ----.     |
                 +-----'
[config.h.top] --+
[config.h.bot] --'

Makefile.in -------------------------------> Makefile.in

在配置软件包的过程中使用的文件：

                       .-------------> config.cache
configure* ------------+-------------> config.log
                       |
[config.h.in] -.       v            .-> [config.h] -.
               +--> config.status* -+               +--> make*
Makefile.in ---'                    `-> Makefile ---'

SofTool.CN Note:
说实话，我看上面的2个示意图，还是比较费解的 :-(
其实，我认识大家可以看 https://www.softool.cn/read/autoconf_makefile/03.html 中的示意图。